تُشكل قضية تلوث نهر النيل تحديًا كبيرًا للجهات المختصة، والتي يجب أن تبذل قصارى جهدها لمنع هذا التلوث أو على الأقل التقليل منه قدر الإمكان، وتفعيل القوانين والضوابط التي تمنع إلقاء الملوثات فيه، ووضع خطط قوية لمواجهة أسباب التلوث ومنعها، فنهر النيل يحمل أهميةً كبرى لا يُستهان بها، وتلوث مياهه يُسبب كوارث كثيرة لا حصر لها.