يؤثر تلوث المياه على السلسلة الغذائية الطبيعية، إذ إنه ونتيجة للملوثات التي تتناولها بعض الكائنات المائية الصغيرة؛ كالرصاص والكادميوم فإنها تعمل على نقل تلك الملوثات إلى الكائنات الأخرى التي تتغذى عليها والتي يتم استهلاكها بواسطة الأسماك الأخرى مما يؤدي إلى موتها ونقصان أعدادها كنتيجة طبيعية